“普适计划”培养方案
“普适计划"面向厦门大学医学与生命科学学部四所学院（生科、医学、药学、公卫）招生，学生进入书院之后拥有学院生和书院生双重身份。书院推行住宿书院制与全方位导师制，充分利用学生课余时间开展各类通识教育活动，旨在提升学生人文素养、培养学生健全人格。2015年起，博伊特勒书院每年从厦门大学生科、医学、药学、公卫四所学院本科新生中招收150名学生进入书院接受”普适计划”培养至本科毕业。
通识教育培养
博伊特勒书院强调全面发展，是各学院人才培养的有效补充和深入优化。书院的学生不仅仅要有扎实的专业基础和批判性思维，同时也要有深厚的文化素养，涉猎广泛，善于交流。书院在学生课余时间积极开展学生通识教育，邀请人文社科领域知名专家学者以沙龙，讲座等形式开展，为学生讲授艺术、历史、法律、人文等课外领域知识，启迪心智，引导学生广为涉猎人文社科典籍。迄今为止，已有诺贝尔奖得主博伊特勒教授，屠呦呦诺奖幕后功臣苏新专教授等为书院同学带来内容丰富的讲座。
全方位导师制
为了全方面解决书院学生在学习生活中的各种问题与需求，博伊特勒书院为书院学生配备了“专业导师”、“思政导师”、“通识导师”与“朋辈导师”。专业导师 10位，由各学院资深专业教授担任，负责在学生课余时间解答专业课程学习疑问；思政导师4位，由各学院新生辅导员担任，负责管理书院学生组织，指导书院学生活动，开展思政工作，并及时解决学生生活上的困惑与难题；通识导师 18位，由书院特聘人文社科学院知名教授担任，负责开展通识教育讲座，提升学生人文涵养，引领学生进行自由探索与思考；朋辈导师共计 14位，由各学院优秀学长学姐担任，负责为书院学生提供数学、物理、化学及英语四门公共课程的课后辅导，接受学生随时预约，从同辈人的角度为学生提供所需帮助。
住宿书院制
书院采取集中住宿制并配备了良好的住宿条件。书院住宿园区建设创客空间及综合活动室，提供 3D打印机、多功能机床、多功能缝纫机、打磨机、激光切割机、高档电脑等设施，为学生进行发明创造提供硬件条件和空间。同时，书院设立学生活动室，可供学生活动、英文电影鉴赏、图书阅览、教师答疑等活动，并建设导师工作室 3间，便于英语角、生活辅导等学生活动的开展，营造温馨的书院小社区，使书院成为师生共有、共建、共享的文化场所和公共空间。园区公共区域均安装门禁和监控，保证书院区域进出畅通有序，方便导师查看书院设备的使用情况，并为书院提供有效的安全保障。
自主管理模式
书院推行学生“自主管理”模式，成立博伊特勒书院学生联合会（简称博联会），设立联合会主席团，下设办公室、学术部、文宣部、外联部、运营部等部门，由学生自主管理规划书院学生活动，发挥学生的主体作用。目前书院已与海外教育学院合办三场形式多样的英语角活动。同时，书院创办博伊特勒书院易班网络文化工作室、微信网络文化工作室，为书院同学提供网络文化阵地和网络产品创作的摇篮。